醫療特色方面，本科在臨床醫療上提供以下主要特色之服務：

• 各式胸腔微創手術，可治療下列疾患:

肺部方面: 如肺癌、肺部良性腫瘤、不明診斷之病變、氣胸、膿胸或慢性肋膜積水等。

食道方面: 食道癌、食道良性腫瘤、食道憩室、食道狹窄、食道破裂或其他傷害等。

縱膈腔方面: 良性或惡性胸腺瘤、其他縱膈腔腫瘤、重症肌無力等。

胸壁方面: 漏斗胸等先天性畸形、良性或惡性胸壁腫瘤等。

• 單孔胸腔鏡手術，可治療上述疾病中病情較單純者。
• 達文西(機器人手臂)手術，主要可用於治療肺癌、食道癌與胸腺疾病等。
• 微創肋骨骨折固定手術。
• 各式氣管手術，包含腫瘤與狹窄等。
• 肺腫瘤定位消融手術，可幫助不適合接受手術的病人。

除了上述各項胸腔外科手術外，本科亦致力於治療末期肺病之患者。郭光泰部主任曾至美國杜克大學與日本京都大學進修肺臟移植，本院已經於民國107年7月取得肺臟移植醫院的資格，成為國內少數具備此資格的醫院；目前已經展開相關業務，以嘉惠末期肺病患者。