本院胸腔外科於民國97年7月雙和醫院開院時即成立，初期由萬芳醫院王孔民醫師與北醫附醫連允昌主任共同支援本科業務，民國98年7月張統優醫師加入服務陣容，而王良順副院長與郭光泰主任分別於民國99年2月與6月陸續加入本科；此外，段奇瑋醫師亦曾於民國104年11月至106年1月間於科內服務，民國109年6月，吳維喬醫師加入本科行列，民國111年11月，本院訓練的洪邦傑醫師也正式升任主治醫師。

本科於民國99年通過胸腔外科醫師訓練中心評鑑，每年可訓練兩名專科醫師。目前科內有科主任1名與專任主治醫師5名(含科主任與支援台東馬偕醫院之黃靖文醫師)、住院醫師三名(R5陳宣羽醫師、陳俊諺醫師與R4李致詮醫師)、專科護理師2名與科秘書1名；其中擔任教職者有：部定教授1名。本科強調教學、服務與研究並重，每年均有數篇論文發表於SCI期刊，研究計畫亦屢獲國科會通過補助。