研究發展處（研推中心、共儀中心、動物中心、核心實驗室）
事業發展處（商品化規劃中心、產鏈中心、技轉中心、經營管理組、Biodesign Center、生醫加速器）
人體研究處（JIRB、JCRC、JBB）
數 據 處（臨床數據中心、校務研究中心、健康資料加值暨統計中心、生物資訊中心）
圖書館校總館（研究競爭力系統、期刊領域排名查詢、掠奪性期刊初檢服務etc.）
國家科學及技術委員會
國家衛生研究院
中央研究院
國家級人體生物資料庫整合平台