醫療特色方面，本科在臨床醫療上提供以下主要特色之服務：

•   各式胸腔微創手術，可治療下列疾患:

肺部方面: 如肺癌、肺部良性腫瘤、不明診斷之病變、氣胸、膿胸或慢性肋膜積水等。

食道方面: 食道癌、食道良性腫瘤、食道憩室、食道狹窄、食道破裂或其他傷害等。

縱膈腔方面: 良性或惡性胸腺瘤、其他縱膈腔腫瘤、重症肌無力等。

胸壁方面: 漏斗胸等先天性畸形、良性或惡性胸壁腫瘤等。

•   單孔胸腔鏡手術，可治療上述疾病中病情較單純者。

•   達文西(機器人手臂)手術，主要可用於治療肺癌、食道癌與胸腺疾病等。

•   微創肋骨骨折固定手術。

•   各式氣管手術，包含腫瘤與狹窄等。

除了上述各項胸腔外科手術外，本科亦致力於治療末期肺病之患者。郭光泰主任曾至美國杜克大學與日本京都大學進修肺臟移植，目前本院即將取得肺臟移植醫院的資格，成為國內第八家具備此資格的醫院；近期將展開相關業務，以嘉惠末期肺病患者。